バイオインフォマティクス特論

2019-09-25 (水) 14:51:22 (28d) | Topic path: Top / 授業 / バイオインフォマティクス特論
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Lesson 01: タンパク質相同性検索の概要

  • セントラルドグマ
  • DNA (A, T, G, C)
  • RNA (A, U, G, C)
  • mRNA
  • コドン(mRNA塩基3つ→アミノ酸1つ)
  • アミノ酸(20種類)
  • タンパク質(アミノ酸が直鎖状に結合したもの)
  • タンパク質の構造(一次,二次,立体)
  • タンパク質の相互作用(結合して機能が発現)
  • タンパク質の機能ドメイン(結合する部分)
  • タンパク質の相同性
  • タンパク質相同性検索
  • タンパク質相同性検索に関する研究の紹介

Lesson 02: ペアワイズ配列アラインメント

Lesson 03: 多重配列アラインメント

Lesson 04: 配列を用いた相同性検索

Lesson 05: プロファイルHMMを用いた相同性検索

Lesson 06: 統計解析ソフトRの基礎

Lesson 07: Rによる統計分析

Lesson 08: Rによる相関分析

Lesson 09: Rによる主成分分析

Lesson 10: Rによるクラスター分析 1(階層型クラスタリング)

Lesson 11: Rによるクラスター分析 2(k平均法)

Lesson 12: Rによる回帰分析

Lesson 13: Rによるカテゴリー分析 1(決定木)

Lesson 14: Rによるカテゴリー分析 2 (SVM)

Lesson 15: Rによるバイオ・データ・マイニング総合演習

  • 教師なし学習(答なし)
    • 統計分析
    • 相関分析
    • 主成分分析
    • クラスター分析
      • 階層型クラスタリング
      • k-平均法
      • スペクトラル・クラスタリング
  • 教師付き学習(答あり)
    • 回帰分析(答が数値)
      • 単回帰分析
      • 重回帰分析
    • カテゴリー分析(答がカテゴリー)
      • 決定木
      • SVM
添付ファイル: filebioinformatics.png 90件 [詳細]
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