授業/バイオインフォマティクス特論
をテンプレートにして作成
開始行:
#ref(./bioinformatics.png,wrap,nolink,25%)
*Lesson 01: セントラル・ドグマ [#qa65d9bb]
-セントラル・ドグマ
--[[HD セントラルドグマ -synra editon- 日本語ナレーション...
-DNA (A, T, G, C)
-RNA (A, U, G, C)
-mRNA
-コドン（mRNA塩基3つ→アミノ酸1つ）
-アミノ酸（20種類）
-タンパク質（アミノ酸が直鎖状に結合したもの）
-タンパク質の構造（一次，二次，立体）
-タンパク質の相互作用（結合して機能が発現）
-タンパク質の機能ドメイン（結合する部分）
-タンパク質の相同性
-タンパク質相同性検索
-タンパク質相同性検索に関する研究の紹介
*Lesson 02: ペアワイズ配列アラインメント [#z0e624df]
-[[ClustalWでペアワイズ・アラインメントを行う>バイオ・デ...
*Lesson 03: 多重配列アラインメント [#r0ef7dae]
-[[ClustalWで多重アラインメントを行う>バイオ・データ・マ...
*Lesson 04: 配列を用いた相同性検索 [#w139e967]
-[[BLASTで相同性検索を行う>バイオ・データ・マイニング/BLA...
*Lesson 05: プロファイルHMMを用いた相同性検索 [#s315ad67]
-[[HMMERで相同性検索を行う>バイオ・データ・マイニング/HMM...
*Lesson 06: 統計解析ソフトRの基礎 [#a437ad38]
-[[WindowsでRを使う>機械学習/WindowsでRを使う]]
-[[MacでRを使う>機械学習/MacでRを使う]]
-[[Rの基本>バイオ・データ・マイニング/Rの基本]]
-[[Rでデータを読み込む>バイオ・データ・マイニング/Rでデー...
*Lesson 07: Rによる統計分析 [#ea0e8307]
-[[Rで統計分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで統計分析...
-[[Rで検定する>バイオ・データ・マイニング/Rで検定する]]
*Lesson 08: Rによる相関分析 [#o1c12af8]
-[[Rで相関分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで相関分析...
*Lesson 09: Rによる主成分分析 [#q30bc791]
-[[Rで主成分分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで主成分...
*Lesson 10: Rによるクラスター分析 1（階層型クラスタリング...
-[[Rで階層クラスタリングを使う>バイオ・データ・マイニング...
*Lesson 11: Rによるクラスター分析 2（k平均法） [#y9274849]
-[[Rでk平均法を使う>バイオ・データ・マイニング/Rでk平均法...
-[[Rでスペクトラル・クラスタリングを使う>バイオ・データ・...
*Lesson 12: Rによる回帰分析 [#ra7bac4e]
-[[Rで回帰分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで回帰分析...
*Lesson 13: Rによるカテゴリー分析 1（決定木） [#s846bd1d]
-[[Rで決定木を使う>バイオ・データ・マイニング/Rで決定木を...
*Lesson 14: Rによるカテゴリー分析 2 (SVM) [#o37eaf24]
-[[RでSVMを使う>バイオ・データ・マイニング/RでSVMを使う]]
*Lesson 15: Rによるバイオ・データ・マイニング総合演習 [#r...
-教師なし学習（答なし）
--統計分析
--相関分析
--主成分分析
--クラスター分析
---階層型クラスタリング
---k-平均法
---スペクトラル・クラスタリング
-教師付き学習（答あり）
--回帰分析（答が数値）
---単回帰分析
---重回帰分析
--カテゴリー分析（答がカテゴリー）
---決定木
---SVM
-[[Rでデータを読み込む>バイオ・データ・マイニング/Rでデー...
-[[分析練習用データ>授業/バイオインフォマティクス特論/分...
終了行:
#ref(./bioinformatics.png,wrap,nolink,25%)
*Lesson 01: セントラル・ドグマ [#qa65d9bb]
-セントラル・ドグマ
--[[HD セントラルドグマ -synra editon- 日本語ナレーション...
-DNA (A, T, G, C)
-RNA (A, U, G, C)
-mRNA
-コドン（mRNA塩基3つ→アミノ酸1つ）
-アミノ酸（20種類）
-タンパク質（アミノ酸が直鎖状に結合したもの）
-タンパク質の構造（一次，二次，立体）
-タンパク質の相互作用（結合して機能が発現）
-タンパク質の機能ドメイン（結合する部分）
-タンパク質の相同性
-タンパク質相同性検索
-タンパク質相同性検索に関する研究の紹介
*Lesson 02: ペアワイズ配列アラインメント [#z0e624df]
-[[ClustalWでペアワイズ・アラインメントを行う>バイオ・デ...
*Lesson 03: 多重配列アラインメント [#r0ef7dae]
-[[ClustalWで多重アラインメントを行う>バイオ・データ・マ...
*Lesson 04: 配列を用いた相同性検索 [#w139e967]
-[[BLASTで相同性検索を行う>バイオ・データ・マイニング/BLA...
*Lesson 05: プロファイルHMMを用いた相同性検索 [#s315ad67]
-[[HMMERで相同性検索を行う>バイオ・データ・マイニング/HMM...
*Lesson 06: 統計解析ソフトRの基礎 [#a437ad38]
-[[WindowsでRを使う>機械学習/WindowsでRを使う]]
-[[MacでRを使う>機械学習/MacでRを使う]]
-[[Rの基本>バイオ・データ・マイニング/Rの基本]]
-[[Rでデータを読み込む>バイオ・データ・マイニング/Rでデー...
*Lesson 07: Rによる統計分析 [#ea0e8307]
-[[Rで統計分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで統計分析...
-[[Rで検定する>バイオ・データ・マイニング/Rで検定する]]
*Lesson 08: Rによる相関分析 [#o1c12af8]
-[[Rで相関分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで相関分析...
*Lesson 09: Rによる主成分分析 [#q30bc791]
-[[Rで主成分分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで主成分...
*Lesson 10: Rによるクラスター分析 1（階層型クラスタリング...
-[[Rで階層クラスタリングを使う>バイオ・データ・マイニング...
*Lesson 11: Rによるクラスター分析 2（k平均法） [#y9274849]
-[[Rでk平均法を使う>バイオ・データ・マイニング/Rでk平均法...
-[[Rでスペクトラル・クラスタリングを使う>バイオ・データ・...
*Lesson 12: Rによる回帰分析 [#ra7bac4e]
-[[Rで回帰分析する>バイオ・データ・マイニング/Rで回帰分析...
*Lesson 13: Rによるカテゴリー分析 1（決定木） [#s846bd1d]
-[[Rで決定木を使う>バイオ・データ・マイニング/Rで決定木を...
*Lesson 14: Rによるカテゴリー分析 2 (SVM) [#o37eaf24]
-[[RでSVMを使う>バイオ・データ・マイニング/RでSVMを使う]]
*Lesson 15: Rによるバイオ・データ・マイニング総合演習 [#r...
-教師なし学習（答なし）
--統計分析
--相関分析
--主成分分析
--クラスター分析
---階層型クラスタリング
---k-平均法
---スペクトラル・クラスタリング
-教師付き学習（答あり）
--回帰分析（答が数値）
---単回帰分析
---重回帰分析
--カテゴリー分析（答がカテゴリー）
---決定木
---SVM
-[[Rでデータを読み込む>バイオ・データ・マイニング/Rでデー...
-[[分析練習用データ>授業/バイオインフォマティクス特論/分...
ページ名:
![[PukiWiki]](https://xn--p8ja5bwe1i.jp:443/wiki/image/banner.png "[PukiWiki]")