授業/バイオインフォマティクス特論/分析練習用データの変更点

分析練習用のデータは、Rのパッケージや[[UCI Machine Learning Repository>http://archive.ics.uci.edu/ml/index.html]]から入手できます。

*Rのパッケージに含まれているもの [#o597ca63]
** 糖尿病 diabetes [#w28e1651]
442人の糖尿病患者について、年齢、性別、BMI、平均血圧、6種類の血清測定値から1年後の糖尿病の進行度を予測する問題です。
-larsパッケージ

**構造活性相関 dhfr [#b6b01d6b]
325個の化学物質について、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(dihydrofolate reductase, DHFR) という酵素と反応する (active) かしない (inactive) かを判別する問題です。
化学物質は228の特徴で表されています。
-caretパッケージ


*UCI Machine Learning Repositoryに含まれているもの [#lb906471]
**乳ガン診断 Breast Cancer Wisconsin (Diagnostic) [#a967cc19]
569症例の乳房の腫瘍について、10種類の腫瘍の特徴（それぞれの平均値、標準偏差、最悪値）から腫瘍が悪性 (M) か良性 (B) かを判別する問題です。
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Breast+Cancer+Wisconsin+%28Diagnostic%29]]
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Breast+Cancer+Wisconsin+%28Diagnostic%29:http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Breast+Cancer+Wisconsin+%28Diagnostic%29]]

**アメリカ国勢調査 Adult [#hff1d5f9]
48,842人の国勢調査の記録から、年齢、職種、学歴、性別などから年収が5万ドル以上 (>50K) かそうでないか (<=50K) を予測する問題です。
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Adult]]
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Adult:http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Adult]]

**ワイン Wince [#tc859eea]
178本のワインについて、アルコール、リンゴ酸、灰などの化学物質の成分からワインの等級 (1-3) を分類する問題です。
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine]]
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine:http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Wine]]

**中古車審査 Car Evaluation [#mef79e29]
1,728台の中古車について、購入価格、維持費、ドアの数、定員、荷室の広さ、安全性から中古車として不可 (unacc)、可 (acc)、良 (good)、優 (v-good) を判定する問題です。
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Car+Evaluation]]
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Car+Evaluation:http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Car+Evaluation]]

**森林火災 Forest Fires [#b3a205bd]
ポルトガルのモンテジーニョ自然公園で発生した517件の森林火災の事例について、発生場所、発生月、発生日、気温、湿度、風速などから、延焼面積を推定する問題です。
-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Forest+Fires]]

-[[http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Forest+Fires:http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Forest+Fires]]