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- バイオ・データ・マイニング/BLASTで相同性検索を行う へ行く。
このページはまだ書きかけです. *はじめに [#redbd380] ここでは,''BLAST''を使って相同性検索を行います. *相同性検索 [#x948b460] DNAやタンパク質が進化的に共通の祖先を持つものを''相同体'' (homologue) といい,DNAやタンパク質が進化的に共通の祖先を持つことを''相同性'' (homology) といいます. DNAデータベースの中からクエリーとして与えられた塩基配列の相同体を見つける,あるいは,タンパク質データベースの中からクエリーとして与えられたアミノ酸配列の相同体を見つけることを''相同性検索''といいます. *BLAST [#e4689043] ''BLAST''は配列をクエリーとして相同性検索を行うツールです. BLASTには,DNAの塩基配列をクエリーとして塩基配列を検索する''blastn'',タンパク質のアミノ酸配列をクエリーとしてアミノ酸配列を検索する''blastp'',DNAの塩基配列をクエリーとして(それを翻訳して)アミノ酸配列を検索する''blastx''などが含まれています.