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*はじめに [#redbd380]
ここでは,''BLAST''を使って相同性検索を行います.
*相同性検索 [#x948b460]
DNAやタンパク質が進化的に共通の祖先を持つものを''相同体'' (homologue) といい,DNAやタンパク質が進化的に共通の祖先を持つことを''相同性'' (homology) といいます.
DNAデータベースの中からクエリーとして与えられた塩基配列の相同体を見つける,あるいは,タンパク質データベースの中からクエリーとして与えられたアミノ酸配列の相同体を見つけることを''相同性検索''といいます.
*BLAST [#e4689043]
''BLAST''は配列をクエリーとして相同性検索を行うツールです.
BLASTには,DNAの塩基配列をクエリーとして塩基配列を検索する''blastn'',タンパク質のアミノ酸配列をクエリーとしてアミノ酸配列を検索する''blastp'',DNAの塩基配列をクエリーとして(それを翻訳して)アミノ酸配列を検索する''blastx''などが含まれています.