バイオ・データ・マイニング/Rでk平均法を使う のバックアップ(No.1)

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  • 1 (2011-12-12 (月) 18:11:12)
  • 2 (2011-12-12 (月) 19:48:18)
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  • 4 (2012-11-28 (水) 09:33:47)
  • 5 (2013-12-20 (金) 12:27:21)
  • 6 (2013-12-23 (月) 09:56:39)
  • 7 (2018-10-25 (木) 10:26:53)

はじめに †

『Rによるバイオインフォマティクスデータ解析』の7.9.1節「k-menas」を参考にして，k平均法を行います．

準備 †

Rのインストールについては，次のページを見てください．

• MacでRを使う
• WindowsでRを使う

まず，x座標とy座標が平均1，分散0.3の100個の点を正規分布で生成し，これをc1とします． 次に，x座標とy座標が平均1，分散0.3の100個の点を正規分布で生成し，これをc2とします． c1とc2をまとめて，dataとし，これをプロットします．

set.seed(123)
x1 = rnorm(100, mean=1, sd=0.3)
y1 = rnorm(100, mean=1, sd=0.3)
c1 <- cbind(x1, y1)
x2 = rnorm(100, mean=-1, sd=0.3)
y2 = rnorm(100, mean=-1, sd=0.3)
c2 <- cbind(x2, y2)
data1 <- rbind(c1, c2)
colnames(data1) <- c("x", "y")
plot(data1)

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